我国小黑麦育种技术在国际上处于领先地位，但由于我国小黑麦遗传基础相对比较狭窄，种质资源多样性不足，抗源材料比较单一，不适应新时期小黑麦育种需要。
中葡政府间国际科技合作项目“中葡小黑麦穿梭育种和遗传改良”，中国农业科学院作物科学研究所与葡萄牙UTAD大学合作，引进葡萄牙小黑麦优良品种（系）38份，通过与我国优良主导小黑麦品种（系）杂交，创制出一批产量高、品质优、抗性强的特异小黑麦育种材料，选择优良株系与我国小黑麦不育系组群进行小黑麦轮回选择育种，培育出39个具有鲜明特点的新品系，并利用MS2显性雄性核不育基因构建了小黑麦性状基因库。
新创制的优异新种质，其中8个苗头新品系产量较对照增产10%-35%，蛋白含量提高9%-16%，对白粉病免疫，高抗叶、条、秆锈，特别是对酸、碱的耐受力得到显著加强，已有3个优良品系升入鉴定试验。利用MS2不育基因构建的小黑麦性状基因库，对提高小黑麦育种效率，缩短育种周期功效显著。项目研发的利用MS2不育基因对小黑麦进行轮回选择的育种技术，居国际小黑麦育种技术领先水平。
该项目的实施，通过国际合作引进葡萄牙小黑麦优良品种，丰富了我国小黑麦的遗传基础和抗耐性优良基因，改进了我国小黑麦遗传资源多样性，对推动我国优良小黑麦育种进程具有重要意义。
