尽管儿童药有着庞大的市场，同时伴随着前述的多方因素整个规模仍有望快速成长，但是受制于儿童药物使用对安全性要求高、新产品不容易被市场接受以及药企投入回报周期长等问题，儿童药产业现状仍然处于初级水平，可以说是生存在成人用药的阴影之下。
相比于儿童药市场规模占到全国总体医药市场规模的近10%，截至到2013年1月我国国产药品批文共有18万余条，其中专用于儿童的药品指通用名中有明确说明儿童用药的药品批文仅3000余条，涉及品种400多个。3000余条批文中，超过六成为中成药，400多个品种超过八成为中成药，从剂型的角度看颗粒剂等口服剂型占主导地位。
有资料表明，国内医药市场现有3500多个制剂品种，90%的药品无适用于儿童的剂型，其中写明供儿童使用的只有70多种，此外全国6000多家药厂中专门生产儿童用药的企业只有10多家。
在我国儿童用药中，约有50%左右是以成人用药减半对儿童使用，有80%的患儿家长表示，自己曾给孩子服用过减少分量的成人药。许多药品没写是否适用于儿童，不良反应也不明确。很多时候儿科医生往往是凭经验治病开药。我国儿童用药有50%是超说明书用药的。儿童不合理用药直接导致不良反应发生率居高不下，儿童用药不良反应发生率约12.9%，其中新生儿用药不良反应发生率更高达24.4%.
针对儿童药产业存在的多方面问题，国家自2010年开始明显加大了支持力度，出台的多个文件中均提及儿童药的发展，政府的关注度提高有望为儿童药企创造更优质的竞争环境，推动更多的资源进入市场。
未来支持性政策的持续出台依然可以期待，例如在儿童药研发方面，虽然国家相关部门在强调儿童用药研发的重要性，却一直没有出台具体的鼓励政策，参照2013年2月份发布的《关于深化药品审评审批改革进一步鼓励创新的意见》，落实性政策可以涉及几个方面：鼓励创新药申报时一并申报儿童剂型和规格，针对儿童特殊疾病、罕见病研究开发的创新药，纳入特殊审批程序;仿制药的儿童用规格和剂型申请，可以优先受理和审评;研究儿童用药在招标、定价、医保等方面的综合鼓励措施。
从医保目录的角度分析，相比于2004版医保无论是化学药还是中成药板块没有提及儿童专用药，2009版国家医保目录有所改进，有13个化学药提及“限儿童及新生儿使用”，有45个儿童专用中成药，但相对整体目录内1140个西药品种、987个中药品种来说，绝对数量仍然较少。
不过对应2010年版的世界卫生组织《儿童基本药物标准清单》，我国2009版医保内儿童用药由单一的社保乙类药物组成，而且药物种类匮乏，药品品种数严重不足，其与WHO的清单仅仅有4种药物重叠。儿童专属药物的低可获得性致使我国儿童置于医疗保险制度的盲区，间接地把儿童这一特殊群体排斥在医疗保险制度之外，因此可以认为2009版医保不能完全满足儿童用药需求，未来需要政府继续尝试将更多儿童药物纳入医保范围。
